水利部中国科学院水工程生态研究所(原水利部中国科学院水库渔业研究所，以下简称研究所)成立于1987年，该所本部占地30余亩，位于武汉市武昌区雄楚大街578号，另建有占地104亩的水利部水生态与生物资源研究试验基地，位于武汉市汉阳区。研究所是中国水利系统专门从事水工程生态研究的科研事业单位，现有职工117人，其中研究员12人，副研究员31人，中初级研究人员64人，设有4个研究室、1个实验中心、1个信息中心、1个工程中心，出版学术性双月刊《水生态学杂志》，是中国水利学会水生态专业委员会的挂靠单位。研究所以水利工程建设有关的生态与环境问题及其相关治理措施的基础理论与应用技术研究为主攻方向，为国家实施可持续发展战略提供理论与技术支撑。研究所现已成为我国专门针对水利水电工程生态影响开展研究的科研机构，形成了鲜明的学科特色，国际国内学术影响力不断增强。 目前，研究所已经建设有分子生态学、鱼类驯育、鱼类行为学、过鱼设施等专门实验室，在国内率先拥有了在室内研究、测试鱼类克流和翻越障碍能力的实验条件。研究所近10年的野外调查研究以长江流域和西南诸河为主，足迹遍布我国的各大流域及其相关的湖泊、水库，不仅掌握了大量的基础资料，而且初步建立了针对我国不同流域特点的水生态调查、评估体系，在水利、水电工程建设对水域生态的影响研究方面，具有重要的地位。此外，研究所还是国际河流科学学会和世界鲟鱼保护学会的理事成员，在珍稀鱼类的分子生态学以及生态水文学等领域享有一定的国际声誉。

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